zinc finger


zinc finger
 Zinc Finger
 Цинковый палец
  Одна из основных групп белков, связывающих ДНК. Являются регуляторами транскрипции, содержат характерный домен, который включает 2 цистеиновых и 2 гистидиновых остатков. Эти аминокислоты взаимодействуют с ионом цинка, а расположенная между ними полипептидная цепочка образует петлю в виде «пальца». Цинковые пальцы C2H2 образуют важное семейство связывающихся с ДНК белковых доменов, встречающихся в транскрипционных факторах эукариот. С2Н2-домены, относятся к одному из наиболее перспективных с точки зрения практического применения ДНК- узнающих белков. Предполагается, что изучение этих доменов позволит проектировать белки с цинковыми пальцами, которые будут узнавать специфические последовательности, что актуально в системах диагностики и генной инженерии. С2Н2 домены обязаны своей структурой в первую очередь атому цинка и связывающим его остаткам цистеина и гистидина. Отсутствие атома цинка ведет к распаду структуры.
 
 Пространственная структура C2H2 домена. Присутствует одиночный ион цинка, который располагается между бета-шпилькой (т.е., антипараллельным бета-листом из двух бета-тяжей) и альфа-спиралью. Атом цинка координируется двумя цистеинами с одного конца бета-листа и двумя гистидинами с С-концевой части альфа-спирали. На N-концевой части альфа-спирали присутствуют аминокислоты в позициях -1, +2, +3 и +6 (в принятой нумерации номер +1 соответствует началу альфа-спирали), которые отвечают за распознавание и связывание с ДНК.

Толковый англо-русский словарь по нанотехнологии. - М.. . 2009.

Смотреть что такое "zinc finger" в других словарях:

  • zinc finger — n any of a class of proteins that typically possess tandem repeats of fingerlike loops of amino acids with each loop containing a zinc binding site at its base consisting of two molecules of cysteine and two molecules of histidine and that… …   Medical dictionary

  • Zinc finger — A zinc finger is a large superfamily of protein domains that can bind to DNA. A zinc finger consists of two antiparallel beta; strands, and an α helix. The zinc ion is crucial for the stability of this domain type in the absence of the metal ion… …   Wikipedia

  • zinc finger — A motif associated with DNA binding proteins. A loop of 12 amino acids contains either 2 cysteine and 2 histidine groups (a cysteine histidine zinc finger), or 4 cysteines (a cysteine cysteine zinc finger), that directly coordinate a zinc atom.… …   Dictionary of molecular biology

  • zinc finger — noun : any of a class of proteins that typically possess tandem repeats of fingerlike loops of amino acids with each loop containing a zinc binding site at its base consisting of two molecules of cysteine and two molecules of histidine and that… …   Useful english dictionary

  • zinc finger — noun A structure, in some proteins, that binds to specific sequences of DNA and regulates genes …   Wiktionary

  • zinc finger — A DNA binding protein motif, characterized by two closely spaced cysteine and two histidine residues that serve as ligands for a single Zn2+ ion. When bound, the structure takes on a conformation in which amino acid side chains protrude in a way… …   Glossary of Biotechnology

  • Zinc finger nuclease — Zinc finger nucleases (ZFNs) are artificial restriction enzymes generated by fusing a zinc finger DNA binding domain to a DNA cleavage domain. Zinc finger domains can be engineered to target desired DNA sequences and this enables zinc finger… …   Wikipedia

  • Zinc finger chimera — Zinc finger protein chimera are chimeric proteins composed of a DNA binding zinc finger protein domain and another domain through which the protein exerts its effect. The effector domain may be a transcriptional activator (A) or repressor… …   Wikipedia

  • Zinc finger and BTB domain-containing protein 16 — Zinc finger and BTB domain containing 16, also known as ZBTB16, is a human gene. PBB Summary section title = summary text = This gene is a member of the Krueppel C2H2 type zinc finger protein family and encodes a zinc finger transcription factor… …   Wikipedia

  • Zinc finger protein transcription factor — Zinc finger protein transcription factors or ZFP TFs, consisting of activators and repressors are transcription factors composed of a zinc finger protein domain (ZFP) and any of a variety of transcription factor effector domains which exert their …   Wikipedia